Курс «Экология микроорганизмов» – дисциплина, изучающая различные аспекты экологии обширного круга микроорганизмов, относящихся к различным царствам живой природы. Различные экологические группы микроорганизмов выполняют в экосистемах Земли множество важнейших функций, способствуя, таким образом, формированию и устойчивости экосистем. Знание экологии микроорганизмов необходимо для изучения  биогеоценологии, почвоведения, лесоведения геологии и других дисциплин.